Rada Programowa sprawuje pieczę nad całokształtem Studiów Matematyczno-Przyrodniczych. Jej szczegółowe zadania precyzuje Regulamin SMP.
Skład Rady Programowej na obecną kadencję jest następujący:
- dr hab. Marcin Andrzejak (chemia)
- dr hab. Dariusz Cichoń (matematyka)
- prof. dr hab. Romuald Janik (Kierownik SMP, fizyka)
- dr hab. Sylwia Kędracka-Krok (biofizyka/biotechnologia)
- prof. dr hab. Leszek Motyka (Przewodniczący Rady, fizyka)
- dr hab. Igor Podolak (informatyka)
- prof. dr hab. Grażyna Stochel (ochrona środowiska)
- dr hab. Barbara Strug (informatyka stosowana)
- dr hab. Sebastian Szybka (astronomia)
- dr hab. Wacław Tworzydło (biologia, neurobiologia)
- dr Aleksandra Wrońska (sekretarz Rady, fizyka)
- prof. dr hab. Wiesław Ziaja (geografia)